Articles Scientifiques

Liste des écrits scientifiques publiés ou non durant la thèse et le poste d’ATER de Tristan Colombo :

Thèse

Algorithmes pour la recherche de gènes en relations fonctionnelles par analyse de proximités et de similarités de séquences. Thèse, université d’Aix-Marseille II, décembre 2004.

Articles

• Looking for high density areas in a graph. Avec Alain Guénoche. Dans Studies in Classification, Data Analysis, and Knowledge Organization, 2007.
• Analyse du contexte génétique d’un gène. Avec Yves Quentin. Dans Actes des Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM’2005), pages 55 – 65, Juillet 2005, Lyon, France.
• BioGraph: a Perl library to manipulate graphs of biological data. Rapport de recherche, Mars 2005.
• Exploration du contexte génétique d’un gène. Avec Belaïd Benhamou, Gwennaele Fichant, et Yves Quentin. Dans Actes de la MAnifestation des JEunes Chercheurs dans le domaine des Sciences et Technologies de l’Information et de la Communication (MAJECSTIC’2003), pages 221 – 224, Octobre 2003, Marseille, France.
• Recherche de quasi-cliques d’orthologues pour la prédiction fonctionnelle. Avec Alain Guénoche et Yves Quentin. Dans Proceedings of the Fourth International Conference on Knowledge Discovery and Discrete Mathematics — Journées de l’Informatique Messine (JIM’2003), pages 203 – 212, Septembre 2003, Metz, France.
• Mining partners of integrated biological systems. Avec Gwennaele Fichant et Yves Quentin. Dans Proceedings of the European Conference on Computational Biology (ECCB’2003), pages 271 – 272, Septembre 2003, Paris, France.
• Functional inference by genetic context analysis — an application to Abc transporters. Avec Belaïd Benhamou, Cécile Capponi, Gwennaele Fichant et Yves Quentin. Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM’2002), Juin 2002, St Malo, France. (Poster)